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Amino-11-UTP,氨基-11-UTP一种化学修饰的核苷三磷酸
发布时间:2025-07-04     作者:zyl   分享到:
Amino-11-UTP(也被称为氨基-11-UTP、Aminoallyl-UTP、11-氨基烷基-UTP)不是种化学上的绘制的核苷三磷酸,隶属于核苷酸并衍生物,其原子核由尿苷三磷酸(UTP)骨架,在一小段被动式的 11 碳烷基链与伯胺基团相接接。原子组成部分与特征在 Amino-11-UTP 的结构的中,尿苷的核苷环保性留了原来的碱基联接实力,不影向其在 RNA 分解成进程中的碱基正常识别。此其独一无二地方内在核苷环上经由碳下载链接下一个伯胺基团。这点氨基链为 11 个碳的烷基链(Undecyl linker),保证了非常的柔软度性与空間,使氨基基团在掺加 RNA 后能离核酸主链,变低空間位阻,并前边续标注中变得更加便于响应。氨基基团都可以与多重官能团发现药剂学响应,如 NHS 酯、异硫氰酸酯、叠氮化物等,建立荧光、酶标、亲和标注或别装饰。Amino-11-UTP 在水饱和溶液中水解度积极,常以三钠盐的结构具备。其分子结构量较普通的 UTP 稍大,但仍可被很多 RNA 聚合反应酶自动识别和加入适量到 RNA 链中。合出与备制Amino-11-UTP 普通由有机化学获得制取。第一方面在尿苷分子式 5 位行成享有化学活化的 linker,然后实现三磷过酸想法,后与三钠盐行成可靠的水溶解性好产品。現代获得技术多使用磷酰氯法或磷酸吡咯啉法来做完三磷酸基团的行成,提高较高的色度和产出率。

Amino-11-UTP

Amino-11-UTP 的运用

RNA 掺入与标记
Amino-11-UTP 主要的应用是作为标记型 UTP 掺入 RNA。转录体系中用部分或全部 Amino-11-UTP 替代常规 UTP,可在 RNA 上引入伯胺基团。后续可通过 NHS 酯偶联荧光染料、biotin、酶标记物(如 HRP)、或其他探针,实现 RNA 的多种功能化修饰。这对于 RNA 探针制备、荧光原位杂交(FISH)、RNA pull-down、定量检测等实验至关重要。

荧光探针制备
使用 Amino-11-UTP 可高效制备荧光标记的 RNA 探针,如 Alexa Fluor、Cy3、Cy5 等荧光染料与氨基基团共价偶联,制成用于检测特定 mRNA、lncRNA 或病毒基因组 RNA 的探针。这类探针具有高灵敏度、低背景、信噪比高的优点。

生物芯片与微阵列
在 RNA 微阵列(microarray)检测中,通过 Amino-11-UTP 掺入的氨基基团,可与固相载体(如玻璃片、硅片)表面官能团(如环氧、醛基)形成共价键,将 RNA 探针牢固固定在芯片上,提高芯片信号的稳定性。

相应的选择:Alkyne choline ,685082-61-5THP(Bz3)-GluCy3 phosphoramiditeCy7 phosphoramidite1807847-98-8,THP-NCSTHP(BZ)3-Amine ,827331-42-0Texas Red maleimide,Texas Red MalTexas Red NH2Texas Red-X NHS ester