蛋白降解靶向嵌合分子(PROTAC)介绍及分子设计要素--西安pg电子娱乐游戏app
生物
一、PROTAC 介绍
PROTAC 全被称为 PROteolysis-TArgeting Chimeras (蛋清吸附靶点嵌合大团伙),都是种杂合双特点小大团伙无机化合物,结构的中富含两者不相同配体,一是泛素链接酶 E3 配体,另外一只是与组织中最终目标靶蛋清配合的配体,两人配体相互之间根据 linker 相互连接,才能造成 “ 三体 ” 聚苯胺物——靶蛋清配体-Linker-E3 配体。PROTAC 氧分子在进到癌体细胞后,其设计中的对方蛋清(Protein of Interest, POI)配体可特情人地与特定的靶蛋清紧密根据,而另一类端行募集 E3 拼接酶然后构成 POI-Linker-E3 ligase 四元组合物,之中 E3 拼接酶可介导泛素紧密根据酶 E2 对 POI 泛素化。被泛素标记图片的 POI 被蛋清酶体判断并分解。此环节不能自己靶蛋清配体长时长赢得口碑紧密根据位点,只需四元组合物暂时的构成便可瞬时完工对方蛋清的泛素化,与此同时 PROTAC 在癌体细胞内可几次反复再生利用。二、PROTAC 分子设计要素
三、PROTAC 分子一般由三部分组成:靶蛋白配体、连接子 Linker 以及 E3 蛋白连接酶配体。
1)E3 连接酶配体的选择(Ligand for E3 Ligase)
E3 连到酶是受到靶蛋清泛素化的最为关键的机构,它的配体属于多方面品种,CRBN (Cereblon)、VHL (von Hippel-Lindau)、IAP 及 MDM2 等为现今常見行业类别。在满足上一场般为先选择类药理作用更加好的 CRBN 度胺类配体,再就是是 VHL 及 IAP 等由内源性配体肽段的产生机构。也需满足到底的靶标蛋清所属体细胞中合适 E3 连到酶的丰度以其PROTAC 的理化检验规定性性能。2)连接子 Linker 的选择(PROTAC Linker)
联接子是联接 E3 联接酶配体和靶球蛋白酶配体的耐腐蚀团伙。联接子的特征对 PROTAC 的細胞膜清晰性、效果和代谢率划分均有非常大的的影晌。自然的联接子时间应适当在服务器上既不影晌多个球蛋白酶相融入又能维系它低的相融入熵。近几年另外将联接子拆除成多连接管、光转移连接管的分析。3)靶蛋白配体的选择(Ligand for Target Protein for PROTAC)
靶球血清配体做 PROTAC 的主导性基团,承接对靶球血清的捕捉到,从而应该有较高的配位效果与使用性。在实计软件中,球血清质已经在的的阻止剂与冲动剂均可以做配体待选,而无关于碳原子报道范文的球血清则可应用高通骁龙量建立与模拟建立等办法去寻找配体,并不标准要求配体与球血清是阻止性或竟争性融合,但需对靶球血清存在较高缜密性。关于企业产品:Thalidomide-O-amido-C6-NH2 hydrochloride(S,R,S)-AHPC-O-Ph-PEG1-NH-Boc(S,R,S)-AHPC-C2-PEG4-N3(S,R,S)-AHPC-C3-NH2 TFA (2361119-88-0 free base)(S,R,S)-AHPC-Me-C10-Br(S,R,S)-AHPC-Me-C7 esterThalidomide-NH-C10-COOHThalidomide-O-amido-C8-NH2 hydrochlorideVHL Ligand-Linker Conjugates 17Thalidomide D4VL285(S,R,S)-AHPC hydrochlorideMV-1-NH-MeVH-298Thalidomide-propargyl(S,R,S)-AHPC-propargyl(S,S,S)-AHPC hydrochlorideTD-106Bestatin-amido-MeThalidomidePACPROTAC BRD4 degrader for PAC-1PROTAC CRABP-II Degrader-2PROTAC CRABP-II Degrader-1PROTAC CRABP-II Degrader-3PROTAC RAR Degrader-1PROTAC ERα Degrader-2PROTAC AR Degrader-4SNIPER(BRD)-1SNIPER(ABL)-033SNIPER(ABL)-039SNIPER(ABL)-058SNIPER(ER)-87SNIPER(ABL)-024SNIPER(TACC3)-1SNIPER(TACC3)-2Biotin-BSBzNH-BSSNIPER(ABL)-013SNIPER(ABL)-015SNIPER(ABL)-019SNIPER(ABL)-020SNIPER(ABL)-044SNIPER(ABL)-047SNIPER(ABL)-049SNIPER(ABL)-050SNIPER(ER)-110FAK ligand-Linker Conjugate 1K-Ras ligand-Linker Conjugate 4K-Ras ligand-Linker Conjugate 5K-Ras ligand-Linker Conjugate 3K-Ras ligand-Linker Conjugate 6ERRα Ligand-Linker Conjugates 1K-Ras ligand-Linker Conjugate 1K-Ras ligand-Linker Conjugate 2Ipatasertib-NH2SLF-amido-C2-COOHAndrostanolone acetateBI-4464(+)-JQ-1I-BET762 carboxylic acidAndrogen receptor antagonist 1ATRA-hydroxyiminoEstrone-N-O-C1-amidoImatinib carbaldehydeCh55-O-C3-NH2PROTAC Her3-binding moiety 1Apcin-ASirReal1-O-propargylSLFSMARCA-BD ligand 1 for ProtacPROTAC BET-binding moiety 1PROTAC BRD9-binding moiety 1PROTAC BRD4-binding moiety 1Dasatinib carbaldehydeDesmethyl-QCA276AP1867-3-(aminoethoxy)Navitoclax-piperazineAP1867-2-(carboxymethoxy)N-piperidine Ibrutinib hydrochloridePROTAC BRD4 ligand-1A-1210477-piperazinylPROTAC IRAK4 ligand-1Palbociclib-propargylSMARCA-BD ligand 1 for Protac dihydrochlorideFN-1501-propionic acidDUPACCR7 Ligand 1GNF5-amido-MeN-Deshydroxyethyl DasatinibPROTAC BET-binding moiety 2IbrutinibQuizartinibBET-IN-6SI-109PROTAC BRD9-binding moiety 1 hydrochlorideEED226-COOHHG-7-85-01-Decyclopropane