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pNA设计的考虑要点:
1.从实际上讲,PNA可以从多个放向和目的意义片断组成杂交种体,但现实情况上,较为常见的是选择性综合(anti-parallelorientation)。
2.通常情况下PNA-DNA双链比相关联的DNA-DNA双链的Tm值高。要花4个单个Tm值可提供1℃。
3.致使PNA与代表的DNA队列有着高感染力,因而PNA不需用太久,普通12-21个碱基就可以。
4.提案可以防止在工作中互补式(Self-complementarity)的突发。在字段设计方案上,以防反方向按顺序(inverserepeats),发夹结构的(hairpinforming)还有回文队列(palindromicsequences)。这是因为PNA与PNA两者之间的之间角色过强,比PNA跟DNA相互的帮助强多了。
5.PNA回文序列中的嘌呤水平不需要太满,应不高于60%,正因为嘌呤越多越好,溶解出来性越差。一同要避免出现6个嘌呤连着在走到一起,很是4个上面的G不断在分着。
6.为改善PNA的溶解度性,可在编码序列里加入Olinker,Elinker,Xlinker也许2个Lys。

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